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豬流行性下痢病毒核酸於田間豬場的環境分布

為了解決gastroenteritis中文的問題，作者蔣昕恆 這樣論述：

豬流行性下痢 (porcine epidemic diarrhea; PED) 引起豬隻急性嘔吐及下痢，因其在新生仔豬可造成高死亡率，故造成豬場嚴重損失，然而在台灣尚無商業化之疫苗，因此以生物安全措施預防及控制豬流行性下痢成為最根本之方法。本研究以即時定量聚合酶鏈鎖反應 (real-time quantitative polymerase chain reaction; real-time qPCR) 檢測4場PED爆發場與1場非爆發場環境中PEDV (porcine epidemic diarrhea virus; PEDV) 之病原核酸，尋找病原可能藏匿的地點，並透過問卷調查獲取有關養豬

場生物安全資料，了解養豬場生物安全等級現況，以評估試驗養豬場中可能的生物安全風險因子。本實驗共蒐集434個環境樣本，爆發場環境樣本的PEDV總體陽性率為39.2％ (149/380)，而非爆發場之所有樣本皆為陰性 (0/54)。於爆發場中，分娩舍之所有樣本，包含常在性的仔豬保溫地墊、隔門及教槽盤、母豬飲水乳頭及飼料槽、內部走廊、風扇開關、風扇葉片、水濂片、門把，可移動性的器械如：推車、注射器、畫記筆、場內工作人員之衣物、手及雨鞋，皆可檢測出PEDV核酸；且相較於未消毒的分娩舍，消毒後的分娩舍設施之檢測陽性率及病毒量皆較低。於保育舍及肉豬舍於本實驗並未檢測出PEDV核酸，但於分娩前母豬之糞便樣本

中，可檢測到病原的核酸。綜合上述，顯示於PED爆發場PEDV可能無所不在，且可能因棟舍消毒不完全，或於不完善的生物安全措施，藉由汙染區域或物品進行不同棟舍間或不同批次間的傳播。在問卷調查的結果中，多數豬場在清潔與消毒方面相對重視，但仍建議加強害蟲、害獸與鳥類的防治措施。另於實施生物安全措施後，也應進行環境監測等效果評估，以了解生物安全的實施成效。

臺灣東北部腸道沙門氏菌流行病學及耐藥機制研究

為了解決gastroenteritis中文的問題，作者林碧珊 這樣論述：

中文摘要………………………………………………………………i英文摘要………………………………………………………………ii目錄……………………………………………………………………iii圖目錄…………………………………………………………………v表目錄………………………………………………………………….vi第一章 緒論……………………………………………………………1第一節、沙門氏菌概論 (Salmonella species)………………………………….1第二節、侵襲性蛋白A基因 (Invasive protein A gene；invA gene)簡介….....2第三節、全自動微生物分析系統 (

Vitek 2 system)簡介…………..........……..2第四節、多態性DNA的隨機擴增 (Random Amplification of Polymorphic DNA；RAPD)簡介………………………………………………………..….....3第五節、基質輔助雷射脫附游離飛行時間質譜儀 (Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight；MALDI-TOF VITEK MS)簡介……….....3第六節、抗藥基因平行轉移 (Horizontal gene transfer；HGT)簡介……..…..4第七節、研

究動機與目的………………………………..…………………......6第二章 材料與方法第一節、實驗材料…………………………………………………………….8第二節、實驗方法………………………………………………………………12第三章 實驗結果第一節、國立陽明交通大學附設醫院分離的沙門氏菌陽性糞便樣本分析...19第二節、以Sanger method DNA定序結果進行系統發生演化樹分析無法有效分群……………………………………………………………………………..20第三節、利用多態性DNA的隨機擴增分析可將樣本分為三類以上型別……………………………………………….…………………………….20第四節、 M

ALDI-TOF VITEK MS Raw data可以發現在光譜m/z 4408 Da出現的基峰樣本，皆為沙門氏菌屬B血清型……………………………...20第五節、沙門氏菌屬沒有透過plasmid將抗藥基因平行移轉至其他腸道共生菌……………………………………………………….……………………….21第四章 實驗討論……………………………………………………....24第五章 參考文獻……………………………………………………....26第六章 實驗結果圖表…………………………………………………31第七章 附錄……………………………………………………………59圖目錄Figure 1國立陽明交通大學附

設醫院分離的66 件樣本資料統計 36Figure 2 2019年國立陽明交通大學醫附設醫院分離出不同血清型沙門氏菌屬的藥物敏感性統計結果 37Figure 3 2020年國立陽明交通大學醫附設醫院分離出不同血清型沙門氏菌屬的藥物敏感性統計結果 38Figure 4收集的66件樣本之流行病學相關調查 39Figure 5宜蘭地區人工餵養雞糞便檢驗 40Figure 6 宜蘭市區生鮮市場販售雞蛋檢驗結果 41Figure 7基因序列系統發生演化樹分析 42Figure 8多態性DNA的隨機擴增分析結果 44Figure 9樣本以質譜儀 (MALDI

-TOF VITEK MS)的分析結果 46Figure 10 Plasmid DNA跑膠體電泳的分析結果 47Figure 11使用紙錠擴散法作抗生素藥物敏感性確認試驗結果 52Figure 12 質體轉染DH5α後以瓊脂稀釋平板塗抹法分析藥物敏感性試驗結果 56Figure 13質體轉染DH5α後以紙錠擴散法分析藥物敏感性試驗結果 57Figure 14 質體轉染DH5α後以紙錠擴散法追加其他抗生素敏感性試驗結果 58表目錄Table 1國立陽明交通大學附設醫院的樣本資料統計結果 31Table 2收集30位病患沙門氏菌及與腸道共感染菌共91株樣本

以Vitek 2 System分析之藥物敏感性結果 32Table 3彙整30位病患之沙門氏菌及與腸道共感染菌共91株樣本的藥物敏感性結果 32Table 4紙錠擴散法藥物敏感性結果製表，挑出對Ampicillin具抗藥性樣本 34